Ditresnarkoba Polda Riau Razia Kampung Rawan Narkoba di Pekanbaru
Ditresnarkoba Polda Riau Razia Kampung Rawan Narkoba di Pekanbaru
Hukrim
JAKARTA - Peneliti postdoctoral Lembaga Biologi Molekuler Eijkman Pradiptajati Kusuma menyatakan virus corona SARS-CoV-2 yang menginfeksi masyarakat Indonesia berasal dari China.
Dia mengatakan hal itu berdasarkan hasil rangkuman atas kurasi Nextstrain terhadap 3 sekuens full genom dari virus SARS-CoV-2 pada pasien di Indonesia yang dikirim ke Platform berbagi data virus influenza internasional (GISAID).
Pradiptajati mengatakan LBM Eijkman telah mengirim tiga sequences virus corona baru dari tiga pasien ke GISAID dengan ID: EIJK2444; EIJK0141; dan EIJK0317. Seluruh data itu tersedia dan bisa diakses oleh siapapun dengan syarat mendaftar di GISAID.
Baca Juga:
"Jadi, 3 sampe tersebut, secara evolusi, semua transmisinya berasal dari China," ujar Pradiptajati lewat akun Facebook, Selasa (5/5).
Meski transmisi berasal China, dia mengatakan virus corona baru pada sampel berasal dari migrasi. Dia berkata SARS-CoV-2 dari China bermigrasi dan berevolusi sepanjang migrasinya, sepanjang lompatan dari satu host ke host lainnya.
Baca Juga:
Seperti manusia, dia mengatakan virus terus berevolusi. Namun, dia berkata virus berevolusi jauh lebih cepat dibanding manusia.
Lebih lanjut, Pradiptajati berkata ada 2 grup (clade) besar, yakni grup Asia dan Eropa yang berevolusi secara paralel di kedua grup tersebut.
Grup tersebut, kata dia, ditandai oleh diferensiasi mutasi asam amino pada protein ORF1B (open reading frame) pada posisi asam amino 314 dan pada protein S (spike) pada posisi asam amino 614.
"Ketiga sampel Indonesia berada di grup Asia. Ini menarik, protein S terdiferensiasi secara regional. Pasti ada fungsi yang berpengaruh, tapi saya lihat gen ACE2 di dunia kok ga berbeda ya," ujarnya.
"Ini untuk diteliti lebih jauh oleh virolog Indonesia. Anyway, namun sekali lagi semua berasal dari China," ujar Pradiptajati.
Terkait dengan hal itu, Pradiptajati berkata 3 sampel virus tersebut mengalami kisah perjalanan yang berbeda. Untuk sampel EIJK2444, dia berkata virus berasal dari Jepang.
"Awalnya berjalan dari China, menuju Australia, dan Jepang. Dan akhirnya di Indonesia. Pada akhirnya, virus ID EIJK2444 memiliki mutasi asam amino pada protein S posisi 76, dari Threonine menjadi Isoleucine," ujarnya.
Untuk sampel EIJK0317, Pradiptajati menyebut virus berasal dari United Arab Emirates. Dia membeberkan awalnya virus berjalan dari China, menuju UK, kemudian Amerika Serikat, United Arab Emirates, dan berakhir di Indonesia.
"Pada akhirnya, virus ID EIJK0317 memiliki mutasi asam amino pada protein ORF1a posisi 461 dari Isoleucine menjadi Valine," ujar Pradiptajati.
Sedangkan untuk sampel EIJK0141, dia menjelaskan virus berasal dari US. Awalnya berjalan dari China, menuju Inggris, kemudian US, dan berakhir di Indonesia.
"Pada akhirnya virus ID EIJK0141 memiliki mutasi asam amino pada protein ORF1a posisi 2103 dari Serine menjadi Phenilalanine. Begitulah kisahnya," ujarnya.
Di sisi lain, Pradiptajati menemukan hal menarik dari hasil kurasi Nextstrain. Pertama, dia menyebut ketiga virus di Indonesia tersebut tidak atau belum menjadi source bagi mutasi virus lainnya di negara lain. Dia berkata virus hanya terjadi pada transmisi lokal.
"Akan dilihat pada sekuens-sekuens baru dari sampel Indonesia," ujar Pradiptajati.
Kedua, dia menyebut semua mutasi kunci virus di Indonesia bersifat non-synonymous. Sehingga, dia merasa perlu penelitian lebih lanjut perihal bagaimana mutasi itu berakibat pada struktur protein virus tersebut dan fungsinya.
"Apakah mengubah fungsi atau tidak. Dan ini serem siy. Mutasi fungsi jika lajunya cepat, bisa susah ditangani. Tapi, para virolog di Lembaga Biologi Molekuler Eijkman bisa menganalisisnya," ujarnya.
Peneliti bidang evolusi dan genetika populasi itu menegaskan interpretasi data itu berdasarkan ketersediaan data dan memiliki limitasi. Sehingga, dia berkata kisah perjalanan virus yang ditemukan di Indonesia bisa berubah seiring dengan bertambahnya sekuens yang masuk ke GISAID.
Dia mengatakan ada ribuan sekuens pembanding yang tersedia di GISAID.
(CNNINdonesia.com)
Ditresnarkoba Polda Riau Razia Kampung Rawan Narkoba di Pekanbaru
Hukrim
kabarmelayu.com, KUANSING Sebanyak 526 rumah di empat Kecamatan yakni Kecamatan Pangean, Kuantan Hilir, Kuantan Hilir Seberang dan Inuman K
Peristiwa
Presiden Prabowo Resmikan Museum Marsinah sebagai Penghormatan terhadap Perjuangan Pekerja
Pemerintahan
Meriah, Riau Bhayangkara Run 2026 Akan Diikuti Sepuluh Ribu Pelari
TNI/Polri
kabarmelayu.com,SIAK Wakil Bupati Siak, Syamsurizal, mengikuti peresmian Koperasi Desa/Kelurahan Merah Putih serentak melalui daring di Ge
Pemerintahan
kabarmelayu.com,PEKANBARU Dinas Pertanian dan Perikanan (Distankan) Kota Pekanbaru, intensif melakukan pemeriksaan kesehatan hewan kurba
Kesehatan
kabarmelayu.com,PEKANBARU Tim SAR gabungan berhasil menemukan seorang anak lakilaki yang sebelumnya dilaporkan hilang tenggelam saat mand
Peristiwa
kabarmelayu.com,PEKANBARU Pasien Puskesmas Simpang Tiga Pekanbaru mengeluh. Ratusan pasien hari ini hanya dilayani oleh satu dokter pada S
Kesehatan
INHIL Pelaksanaan Penerimaan Peserta Didik Baru (PPDB) di MTsN 2 Indragiri Hilir kembali menuai sorotan publik. Sejumlah persoalan mulai
Pendidikan
Aparat Lambat Tutup Warung RemangRemang Cafe KE Lipat Kain, Masyarakat Siap Turun Tangan
Hukrim